Фонд финансовой поддержки сельского хозяйства является оператором страхования в АПК. В 2020 году Фонд утвердил несколько страховых продуктов для растениеводства и животноводства, на которые предоставляется субсидирование части страховых премий. Страхование осуществляется на информационном сервисе Agroinsurance, размещенном на платформе Qoldau.